PDTを1.0.0.v20070917というのに入れ替えたのですが、Run/DebugのビューでPHPコマンドの設定がエラーとなり表示されません。PHP Web ページの方は問題なく表示されています。 Eclipseのバグレポートを見たらそれらしいものがあったので、既に報告済みだと思われます。とりあえずはバグフィックス待ちということになるもよう。
Updateでバージョンアップしたのですが、念のためPDTのall-in-oneを手動でダウンロードして、インストールしてみましたがだめでした。プロジェクトの設定でみても、他のfeatureとの不都合などが見られないため、おそらくPDTのバグだと思います。 今のところ回避方法は見つけてはいません。おそらくバージョンアップに伴うレベルダウンと思われるので、古いfeatureに戻せばよいかと思ったんですが、何故か同じようにエラーになります。なぞです。
現状、PHPのコマンド実行でデバッグなどはしてないので、体制に影響はないのですが、PHPコマンドを実行したいときに、EclipseのRunから実行できないので、(Windowsなので)DOS窓から普通に「php xxx.php」のようにコマンドを叩いて実行しています。